7月24日下午，中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所所級科學數(shù)據(jù)中心舉辦了“單細胞轉錄組數(shù)據(jù)高級分析進階”培訓，旨在幫助科研人員了解和掌握相關技術和工具，以提升自身生物信息分析能力。本次培訓由中心資深工程師黃俞瑋擔任主講人，其研究方向為生物信息學大數(shù)據(jù)分析和流程搭建，目前主要負責單細胞及空間轉錄組方向的分析工作。
黃俞瑋首先向學員們介紹了單細胞轉錄組應用方向及示例，包括細胞類型及功能、細胞群的數(shù)量及比例特征、細胞群的特征基因及功能、細胞群間的發(fā)育順序、細胞群間的相互作用。隨后，她詳細介紹了ViPMAP（https://www.biosino.org/vipmap/home）單細胞轉錄組數(shù)據(jù)高級分析實操，包括高級分析參數(shù)解析及任務提交管理、分析結果解讀。
培訓過程中，學員們積極參與，踴躍發(fā)言，并與主講人在關鍵技術和方法上進行了深入交流和討論，比如是否可以進行Cell Chat分析、如何比較Case和Control組數(shù)據(jù)，以及如何整合和去除批次效應等。通過此次培訓，學員們不僅對單細胞轉錄組的應用有了更深入的了解，還掌握了ViPMAP單細胞轉錄組數(shù)據(jù)高級分析的實際操作，包括高級分析流程的操作及分析報告的生成與解讀等。這將進一步提升學員們對所級科學數(shù)據(jù)中心提供的常規(guī)生物信息分析服務的了解，為科學研究工作提供有力支持。
營養(yǎng)與健康所所級科學數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關主題的培訓活動，以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務。同時，所級科學數(shù)據(jù)中心還設計了相關的調研問卷（詳見文末二維碼），誠邀科研人員提出寶貴的意見和建議，以便進一步優(yōu)化和提升服務質量。通過與科研人員的積極互動和反饋，中心將不斷改進服務流程，提升技術支持質量，為進一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質的服務。
黃俞瑋資深工程師作培訓報告
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